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几天之后，曹跃借口儿子出生正在偷懒，突然得知张之洞张中堂病了，不得不回到住处修养半年以上，所以朝廷改革一事不得不交给曹跃来接手。曹跃一下子懵了，张之洞怎么又生病了？而且如今朝廷的改革缺不了张之洞的稳重和大局观。
所以曹跃连忙打算拜访张之洞，听太医说张之洞是长期劳累所导致，需要静养四五个月才能恢复，如果不休息的话，命不过半年。基于这个原因，工作狂张之洞在家人的劝说之下才停下工作，开始养病休息。
曹跃对此很是不安，带着名贵礼物送到张之洞跟前，张之洞苦笑说你这百年高丽参用的不是地方，一旁的太医忙说张中堂是劳碌导致，不能吃这些火气大的补品，只能慢养静养，最好静养一年。
曹跃苦笑道：“恩师若是静养一年，朝廷就要乱咯。”
张之洞道：“所以到年底科举考试的时候，我再重新主持。”
曹跃也只能接受了，毕竟他也不能累死张之洞吧。
李鸿章回家，张之洞生病，张荫恒外放到东北去做了东北总督，自己的岳父陶模入京之后年纪大了，也处理不了太多的事儿，所以军机处只剩下曹跃、刘名誉、升允、鹿传霖四个。其中升允能力不足，鹿传霖因为是后党出身行事小心翼翼，所以大多数的工作都交给曹跃和刘名誉来做，曹跃只能起早贪黑工作，这当会儿，真是累死个人了。
为了增加军机处的人手，曹跃提携兵部左侍郎冉东、吏部左侍郎徐世昌、礼部左侍郎宋育仁、翰林院大学士瞿鸿机四人进入军机处处理朝政。这四人之中只有瞿鸿机算是经验丰富，而冉东甚至只有秀才功名，算是军机处里除了曹跃学历最低的了。
但是人家曹跃也是大学士——最没有文化的大学士，既不会诗词歌赋又不会做八股文的大学士，怕是古往今来唯一的一位了。
所以冉东进入军机处，不怕他的学历低——有曹跃垫底呢。
曹跃接手张之洞的改革计划之后，才发现这个改革有多难，改革最需要的就是钱了，没钱谈什么改革。朝廷赚钱无非两个办法，增加税负或者国办工厂。然而因为两年的战争，税收无从谈起，且曹跃大手一挥免了这两年华北地区的税负，朝廷的收入少了四分之一。但如果贸然增加南方税负，必定又会引起南方士绅阶层的反抗，给刚刚崛起的民族工业造成损失。
而官办的工厂又面临着管理混乱，侵吞财产，官员只顾自己敛财不顾效益的风险。官民公办工厂也有一个大问题，大家不相信政府，唯恐政府突然将工厂收归国有，私人投资得不到保障。
曹跃立即将工部左右侍郎赵凤昌与唐元湛叫来，与他们商议如何开放商业，如何改革官办工厂的命运问题，赵凤昌说如果想要增加商业流通，首先的一点就是要减少商业流通渠道的税负，如各地厘金的问题。所谓厘金有点类似于保护费，主要是有各地驻军来收取的，是因为清末各地团练武装绿营太多，朝廷无法支付全部粮饷允许其自筹的一种方式。
不过后来大家看厘金比较容易来钱，便你也设立厘金，我也设立厘金，一个县城，出城要收钱，进城要收钱，走到两县交界处也要收钱。厘金制度大大地遏制了商业流通氛围，阻碍了中国商业发展。
曹跃立即说道：“厘金制度将来一定要取消，且国家军队已经逐渐开始取缔了绿营和团练乡勇制度，他们再存在就是不合理的。”
赵凤昌道：“中堂大人，各地政府是不会觉得合理还是不合理的，只要符合他们的利益就行。”
曹跃冷笑道：“这样吧，取缔厘金制度先从取消入门费开始，发布一条命令，大清国取缔进城门和出城门的过路费，如果一旦出现，则谁收钱杀谁。”
“是。”赵凤昌道。
曹跃说道：“这是第一步，我们等一等看，有谁反对取缔城门费，杀一批人，抄一批家，杀鸡敬狗。第二步，八大地区逐渐取缔厘金制度，首选从西北地区和华北地区开始取消厘金，这个时间要明年夏天吧。一年之后就是东北地区和华中地区，再一年之后是华东地区和东南地区，最后是西南地区和华南地区。所以五年之后，全国厘金和城门费全部取缔。”
唐元湛赶紧记下来。
赵凤昌道：“可是还是无法解决接下来的投入，我们还是缺钱呢。”
“大清帝国银行发放红钞的事儿推广得怎么样了？”曹跃问。
“推广力度很大，但是接受能力不强，很多地方是强制推广。”唐元湛道，“大家不认可纸币，或者说他们不认可大清国的纸币。”他皱起眉头说道：“中堂大人，其实我觉得在华北地区推广纸币有一些方向性错误，他们根本就对纸币不认同，我反倒觉得应该在广东上海江苏浙江福建等沿海省份来推广纸币，他们接触过外国纸币，知道纸币的方便。而且这些地方经济发达，拥有更多的银子，能够给朝廷创造更多的利润。”
曹跃道：“好，着令石顺常国良前往南京，我们一站一站地推广纸币，一定要将纸币推广下去，取代银两。最终我们的目的是将中国的银本位制度扭转为政府信誉制度，从而摆脱对金银的依赖，避免国外金银对国内金融的打击。”
“是。”
张之洞改革的重点在于礼部和户部，而曹跃的改革重点在于刑部和工部，接下来曹跃开始寄出金笃男这一大招，开始慢慢通过反腐来增加国库收入了。恰巧有人弹劾杭州知府徐英昌贪赃枉法，曹跃决心以杭州知府为突破口，敲打一匹肥官。随后曹跃下令刑部尚书金笃男前往江浙办案，并且查访当地贪污受贿官吏。
为了保护金笃男，曹跃特地调集了一个营300名禁军士兵日夜保护着金笃男，并告诉他，在杭州办案，不要怕牵扯太大，更不要怕得罪人，该抄家的人就抄家，该发配去新疆或者黑龙江或者云南的或者西藏的，绝对不要顾忌什么。
金笃男理解曹跃的意思，曹中堂还指着这些贪官充实国库呢，害怕事儿小吗？于是他带着三百名士兵，浩浩荡荡地来到了杭州，开始从杭州知府徐英昌身上查起来。